بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین g انسان به روش ایمونوانفورماتیک
نویسندگان
چکیده
سابقه و هدف: ایمونوگلوبولین g (igg) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و سطح igg سرم با شدت بیماریهایی مثل نقائص ایمنی، عفونتها و بیماریهای خود ایمنی ارتباط دارد. لذا igg ارزش تشخیصی بالایی دارد. ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخهای ایمنی وتشخیص دقیق تر بیماریها کمک می کند. این پژوهش با هدف تعیین اپی توپهای ایمونوژن خطی igg انسان با استفاده از ایمونوانفورماتیک انجام شد. روش بررسی: توالی و ساختار سوم igg مرجع انسان در پایگاه داده pdb، ساختار دوم آن توسط نرم افزار phyre2 و اپی توپهای خطی آن توسط نرم افزارهای ellipro و iedb تعیین شدند. یافته ها: مهمترین اپی توپهای خطی igg انسان توسط نرم افزار iedb در ناحیه بین اسید آمینه های 160 تا 175 در زنجیره سبک و 350 تا 360 در زنجیره سنگین معرفی شدند. ۱۱ اپی توپ خطی توسط نرم افزار ellipro در دومینهای ثابت igg انسان ( یکی در ناحیه اتصالی به آنتی ژن (fab) و ۱۰ اپی توپ دیگر در ناحیه ثابت (fc) در دومینهای ثابت 2 و 3 زنجیره سنگین (ch2 و (ch3 با توزیع مساوی( معرفی شد. شاخص ترین اپی توپها (۵ عدد) در دومین ch3 واقع شده ند. نتیجه گیری: در این مطالعه تعداد قابل توجهی از اپی توپهای خطی igg انسان شناسایی شدند. مطالعات آزمایشگاهی قبلی در این زمینه، تایید کننده این نتایج هستند. اپی توپهای تعیین شده ابزار مناسبی جهت تولید آنتی بادیهای مونوکلونال اختصاصی igg، تعیین نقشه اپی توپهای igg و مطالعات فیلوژنیک می باشند.
منابع مشابه
بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین G انسان به روش ایمونوانفورماتیک
Background and objective : Immunoglobulin G (IgG) is the most abundant antibody in serum and extracellular fluids. The amount of serum IgG is associated to severity of some diseases like immunodeficiency, infections and autoimmunity. Therefore IgG has a high diagnostic value. Immunoinformatic is a branch of immunology which helps in solving of immunologic problems, well understanding of immun...
متن کاملتعیین اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه ای
Background: Immunoglobulins are a group of proteins that have important role in defense against microorganisms. Immunoglobulins consist of heavy and light chains. In human, immunoglobulin light chain comprises of two isotypes: Kappa (K) and lambda (λ) based on amino acid differences in carboxylic end of their constant region. Marked changes in the K to λ ratio can happen in monocl...
متن کاملایمونوانفورماتیک و روش های پیشگویی اپی توپ، دانشی پویا با دستاوردهای امیدبخش
روش های نوین ایمونوانفورماتیک راهبردهای تازه ای را جهت شناسایی، طراحی و ساخت اپی توپ های اختصاصی آنتی ژن جهت استفاده در مقاصد گوناگون نظیر؛ واکسن ها، آلرژی ها، ایمنی درمانی و غیره فراهم آورده است. الگوهای تازه در طراحی واکسن ها، شناسایی آلرژن ها و ایمنی درمانی به واسطه اکتشافات مهم در علم ایمنی شناسی و توسعه ابزارها و الگوریتم های پیشگویی اپی توپ های سلول B و T، به نظر امری ضروری است. در این مق...
متن کاملایمونوانفورماتیک و روش های پیشگویی اپی توپ، دانشی پویا با دستاوردهای امیدبخش
روش های نوین ایمونوانفورماتیک راهبردهای تازه ای را جهت شناسایی، طراحی و ساخت اپی توپ های اختصاصی آنتی ژن جهت استفاده در مقاصد گوناگون نظیر؛ واکسن ها، آلرژی ها، ایمنی درمانی و غیره فراهم آورده است. الگوهای تازه در طراحی واکسن ها، شناسایی آلرژن ها و ایمنی درمانی به واسطه اکتشافات مهم در علم ایمنی شناسی و توسعه ابزارها و الگوریتم های پیشگویی اپی توپ های سلول b و t، به نظر امری ضروری است. در این مق...
متن کاملمدلسازی ایمونوانفورماتیکی، ساخت پلاسمیدهای حامل اپی‌توپ‌های CTL ویروس هپاتیت C و بررسی اولیه ایمنی‌زایی آنها
زمینه و اهداف: تاثیرات سرکوب کنندگی برخی از کلیدی ترین پروتئین‌های ویروس هپاتیت c بر سیستم ایمنی و جهش سریع ویروس، توجه را به واحدهای ایمونوژن کوچک و پایدار جلب نمود. لذا، واکسن های مولتی اپی توپ به منظور تمرکز پاسخ ایمنی بر این واحدها معرفی شدند. ولی، به دلیل پاسخ ایمنی نسبتاً ضعیف علیه این واکسن ها، افزایش ایمنی زایی نیازمند تمهیدات بیشتری است. این مطالعه با هدف ساخت پلاسمیدهای حامل اپی‌توپ...
متن کاملایمونوانفورماتیک: نگاهی نو در فهم عملکرد سیستم ایمنی، پایگاه های داده و پیش گویی اپی توپ های ایمونوژنیک
سابقه و هدف: ایمونوانفورماتیک یا ایمونولوژی محاسباتی اخیراً به عنوان زمینه ای مهم و نوین نقش چشمگیری را در علوم آنالیز، مدل سازی و پیشگویی عمل کرد سیستم ایمنی، طراحی واکسن های جدید، تحقیقات آلرژی زایی و اکتشافات دارویی داشته است. این علم نه تنها سبب تسریع تحقیقات علمی شده بلکه به علت تعامل آن با پروژه های ژنوم منجر به دست یابی به اطلاعات بسیار زیادی در ارتباط با ایمنی شناسی گردیده است. در واقع ا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
پژوهش در پزشکیجلد ۴۰، شماره ۱، صفحات ۳۰-۳۵
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023